玉龍化工成功與中國科學院上海有機化學研究所成為長期戰略合作伙伴，雙方的合作內容涵蓋了產品合成工藝改進研究、新產品合成工藝研發、生產全過程先進檢測方法研發、院企科技人員交流、產品企業標準制定等多個方面。2012年，中科院有機所與玉龍化工在廠區內建立了聯合研發中心——“中科院有機所朔州研發中心”，這是有機所在國內的第二家院企聯合研發中心，但是是中科院在山西省化工領域的首家。

此研發中心配備了國內先進的變風量控制技術的實驗室設施，創造了綠色研發環境，可同時容納近百名科研人員從事研發工作；目前已取得并已在生產中應用的成果包括甲基肼合成工藝改進方案、甲基肼含量分析方法、三嗪環合成工藝改進方案、工業導熱油研發等；